בדומה למקובל בכנסת ישראל ובחברות שונות, מתבצעת רוב עבודת ההכנה לדיונים, גיבוש המדיניות והדיון בעניינים השונים במסגרת ועדות משנה הכפופות להנהלה.
לוועדות אלו אין סמכות הכרעה או ביצוע, והחלטותיהן בגדר המלצות בלבד, אשר עוברות לאישור הגורמים המוסמכים (בדרך כלל המזכירות או מליאת ההנהלה). הוועדות דנות בהצעות ובנושאים השונים הדורשים ליבון או תיקון ומגישות את המלצותיהן להכרעת מוסדות החקיקה והביצוע.
מלבד זאת, מפקחות ועדות אלה על פעילות המחלקות האדמיניסטרטיביות האחראיות על הניהול והביצוע. בראש כל ועדה ממנה ההנהלה חבר מחבריה והוא אשר מכנס את הוועדה, קובע את סדר יומה ומנהל את ישיבותיה.
על כל ועדה מוטלת החובה לנהל פרוטוקול מסודר ומפורט של כל ישיבה וישיבה, אשר יישקף נאמנה את דברי הנוכחים בישיבה ואת תוכנה.
רובן המכריע של ועדות משנה אלה מאויש על ידי אנשי ונשות הכדורגל ונציגי מרכזי הספורט הפועלים במסגרת ההתאחדות והקבוצות, אשר חלקם כמובן הם גם חברי הנהלה ונושאי משרות בכירות (יו"ר, מ"מ, מנכ"ל).
הרכב הוועדות אינו קבוע והוא משתנה מעת לעת, תוך שמירה הדוקה על יחסי הכוחות בין המרכזים. מתוקף תפקידם, משתתפים המנכ"ל והסמנכ"ל בדיוני הוועדות כשהקוורום לקיום ישיבות ועדות ההתאחדות הוא נוכחות של 50% מקרב חברי הוועדה.
רשימת ועדות